Vēl pirms Daugavpils Marka Rotko mākslas centra atklāšanas 2013. gada 24. aprīlī tika noiets garš ceļš, lai ideja, kas radās tālajā 2002. gadā, tiktu īstenota un Daugavpilī taptu unikāls veltījums Daugavpilī dzimušā pasaulslavenā mākslinieka Marka Rotko piemiņai ar iespēju skatīt miljoniem vērtus mākslinieka oriģināldarbus. Fakts, ka 20. gadsimta pasaulslavenā amerikāņu mākslinieka Marka Rotko (Markusa Rotkoviča) dzimtā pilsēta ir kādreizējā Dvinska Krievijas impērijā (tagadējā Daugavpils Latvijas Republikā), līdz tam nebija plaši apspriests starptautiskā mērogā.
Daugavpils Marka Rotko mākslas centrs ir izvietots Daugavpils cietokšņa vēsturiskajā artilērijas arsenāla ēkā, kas būvēta 1833. gadā. Lai rekonstruētu artilērijas arsenāla ēku un tajā izveidotu Rotko centru, tika izstrādāti un apstiprināti trīs dažādi Eiropas Savienības līdzfinansēti projekti. Projektus īstenoja Daugavpils pilsētas dome sadarbībā ar Latvijas Republikas Kultūras ministriju, Rotko ģimeni un atbalstītājiem visā pasaulē. Kopumā Daugavpils Marka Rotko mākslas centra tapšana izmaksāja gandrīz 6,5 miljonus eiro. Lielāko finansējuma daļu sedza Eiropas Reģionālās attīstības fonds un Latvijas – Lietuvas pārrobežu programma.
Veicot rekonstrukcijas darbus Artilērijas arsenāla ēkā Daugavpils Mark Rothko Art Centre izveidei, tika atjaunota nozīmīga arhitektūras ansambļa – Daugavpils cietokšņa – daļa. Arsenāla ēkas telpu piemērotība mākslas galeriju, mākslinieku studiju, rezidenču, ekspozīciju telpu, fondu telpu, semināru - konferenču telpu, sarīkojuma telpu izveidei un slavenā gleznotāja Rotko vārds, ciešā sadarbība ar Rotko ģimeni radīti jauni kultūras pakalpojumu piedāvājumu ne tikai Daugavpilī un Latgales reģionā, bet arī Latvijā un Austrumeiropā kopumā.
Izveidotais Daugavpils Marka Rotko mākslas centrs ir daudzfunkcionāls laikmetīgās mākslas un kultūras centrs, vienīgā vieta Austrumeiropā, kur tiek piedāvāta iespēja iepazīties ar pasaules slavenā, Daugavpilī dzimušā mākslinieka, abstraktā ekspresionisma pamatlicēja Marka Rotko oriģināldarbiem.
Artilērijas arsenāla ēkas rekonstrukcijas projekts Daugavpils Marka Rotko mākslas centra izveidei ieguva galveno balvu nominācijā „Restaurācija” Latvijas Būvnieku asociācijas rīkotajā ikgadējā skatē „Gada labākā būve Latvijā 2012”. Daugavpils cietokšņa reģenerācijas projekts ir ieguvis prestižo Eiropas Padomes ģenerālsekretariāta organizētā konkursa „Eiropas Padomes Ainavas balva”.
Daugavpils Marka Rotko mākslas centrs tapa ar mērķi veicināt kultūras tūrisma attīstību Latvijā. Viens no mākslas centra darbības uzdevumiem ir veidot Latvijas un Daugavpils starptautisko atpazīstamību un konkurētspēju kultūras telpā, sekmēt jaunu unikālu kultūras produktu izveidi un kultūras pakalpojuma attīstību. Centrs strādā, lai Daugavpils kultūras procesi iekļautos Eiropas un pasaules kultūras apritē un piedāvātu ne tikai Daugavpils, bet arī Latvijas iedzīvotajiem un tūristiem no visas pasaules pieeju augstvērtīgām profesionālās mākslas izpausmēm.